Methylation Madness: Insight into the Biochemical and Personal Lives of Hypermethylators
V 化学3：メチル化の問題とは？
メチル化とはいったい何なのか、そしてMTHFRとどのような関係があるのか。このテーマは、ここ数年、話題になっている。何が、なぜ、どのように問題なのかを本当に理解するためには、まず、最も基本的な意味でのメチル化とは何なのかを見てみる必要がある。
メチル化とは、3個の水素原子が結合した炭素原子を、ある化合物から別の化合物に移動させる化学的プロセスである。炭素原子は3つだけでなく4つのものと結合できるので、そのオープンボンドを介して他の化学化合物とくっつくことになるのである。これがメチル化化学の長所であり短所である。
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さて、ここで「なぜ」の部分が登場する。メチル化によって化学物質の作用が変化し、体内で別の作用が行われるようになるのである。例えば、デトックス（解毒）がその良い例だ。化学物質が体外に排出されるのに適した化学形式でないことがある。
つまり、腎臓や腸から排出される前に、体が化学物質を別のものに変えなければならないのである。この活動の多くは、肝臓で行われる。「デトックス 」のメインとなる部位。デトックスは、正確な用語というより、むしろ人工的な用語だ。体は、メチル化（CH3）分子、酸素分子（O）（酸化)硫黄分子（S）（硫化)水分子（H2O）（水和）を使って、化学物質を腎臓や腸で除去できるものに変えることができる。
これは説明としては簡単なことで、多くのステップと他の酵素がこれらを働かせる。化学物質を除去するという目的を達成するために、身体はこれらの酵素を一緒に使うこともあれば、単独で使うこともある。例えば、メチル化された後に水素化されたり、酸化された後に水和されたりするわけである。
つまり、身体はこれらすべてを利用して目的を達成するのである。しかし、これらのメカニズムが最高度に機能していない場合はどうなるのだろうか？これは、体が必要とする化学物質を効果的に除去できず、老廃物や副産物、毒性化学物質が体内に蓄積された状態だ。これは、臓器が機能しなくなったり、病気になったりする原因になる。
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何の問題かというと、説明するのが難しい。しかし、平たく言えば、CH3基がくっついたり結合したりするための空きスペースがある化学物質のことだ。これはホルモンや神経伝達物質、外部の化学物質、例えば農薬のようなものである。
であるから、メチル化化学の場合は、できるだけ効果的に作用させることが非常に重要だ。考えるとき、神経伝達物質がシナプスと呼ばれる神経と神経の間の空間に放出される。そして、それが次の神経に差し込まれ、その神経が発火する。
そして、受容体から神経伝達物質が放出される。まあ、そのまま（シナプスに）置いておいても、何度も神経を発火させ続けるだけなのだが。しかし、体はそれを分解して「不活性化」したり、神経に再吸収したりするのである。不活性化させる大きな方法のひとつが、メチル化だ。
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ホルモンは血液中に放出された後、その役割を果たし、その後除去される必要がある。ホルモンが多すぎると、問題や病気の原因になる。例えば、エストロゲンを見てみよう。エストロゲン分子を不活性化し、除去しなければ、エストロゲン優位と呼ばれる状態を引き起こし、蓄積される。
乳がんやその他のがんを引き起こす可能性があるのである。メチル化は、免疫システムを活性化し、DNAをダメージから守るために利用される。このように、メチル化は体のバランスを保ち、化学物質が過剰にならないようにするための重要なツールなのである。
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続けて、CH3分子がどこから来るのかを見てみよう。CH3分子の主な供給源の1つは、アミノ酸のメチオニンである。メチオニンは、あなたの食べ物や地球上のほとんどすべてのタンパク質に含まれている。しかし、それぞれの食品に含まれる量は同じではなく、ほとんどの場合、ほとんどのタンパク質には非常に少なくなっている。
おそらくそれは、メチル化化学に非常に活発に作用するためだろう。しかし、メチオニンはS-アデノシルメチオニン（略してSAMe）と呼ばれるものに変換されることになる。体はエネルギー分子であるATPを取り込んで、メチオニン分子にくっつける（MAT1A遺伝子）。
これが、別の化学物質をメチル化できるようになるための第一歩だ。つまり、メチオニンはメチル化アミノ酸の第一段階なのである。この化学反応には、遺伝学、酵素、補酵素のすべてが関わってくる。この経路にはサルベージメカニズムが組み込まれている。
メチル化アミノ酸はほとんどの食品に含まれていないため、体内で何度も利用できるよう、体内に留めておこうとするのである。これが主なメチル化サイクルである。SAMe分子を使用し、CH3基を別の化学物質に供与し終えた後、これを行うには、S-アデノシルホモシステイン（SAH）になる。
体内でさらに代謝され、ホモシステインとなる（AHCY遺伝子制御酵素を介する）。この体内生成物と心臓病との関係が、メチル化が医師の注目を集める理由だ。多くの研究が、ホモシステインレベルの高さと動脈の詰まりやプラークの蓄積を関連付けている。
つまり、血流に残すにはあまり良い化学物質ではない。メチル化化学が正常に機能していれば、ホモシステイン分子はいくつかの方法で代謝される。メチオニンに戻され、代謝が再開される。さらに別のアミノ酸であるシステインに代謝される。また、メチオニンを分解して硫黄ガスや硫黄化合物として排泄することもできる。メチル化する化合物やプロセスは他にもあるが、ここではMTHFR遺伝子の会話に直接関係するものだけを取り上げる。
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さて、ここで皆さんは、「いつになったらあのMTHFR遺伝子の話をするのだろう」と思っていることだろう。今がその時だろう。MTHFR遺伝子とその役割を理解するためには、遺伝子がどのような働きをしているかを見る必要がある。遺伝子は病気の目印ではなく、体の代謝をコントロールするものである。
遺伝子は、酵素を機能させ、化学プロセスを開始させたり停止させたりするものである。それがメチル化などの体内化学を動かしているのである。通常、遺伝子はオン／オフシステムではない。遺伝子がオフになると、体のプロセスが機能しないことになり、通常、これは生きていることにつながらない。
このような遺伝子の誤作動は大きな病気を引き起こすので、複数の遺伝子の誤作動と相互作用の全体的な意味を説明するには、優秀な遺伝学者が必要であろう。しかし、ここでは、正常な遺伝子機能の単純な変異に絞って議論してみよう。変異株には、野生型（正常な遺伝子)ヘテロ接合型（異なる変異)ホモ接合型（同じ変異）といういくつかの種類がある。
私たちの議論では、それらが存在することを知るだけでよいのである。遺伝子の変種や変異は、その遺伝子が制御するものの機能を大きくしたり小さくしたりすることができる。ステレオセットのボリュームダイヤルのようなものだと考えてほしい。
10段階は部屋の大きさや内装にちょうどいい。12は大きすぎて耳が痛くなり、4は小さすぎてほとんど聞こえない。これが遺伝子の働きである。もし変異株が、制御する酵素やプロセスを速くしすぎれば、過敏になりシステムに過負荷をかけることになる。もし、その変異型が酵素の働きを遅くしすぎると、物事は元に戻り、代謝は非常に遅くなる。そこで、MTHFR遺伝子とその機能、そしてメチル化システムにおける重要性について説明する。
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MTHFRはメチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ遺伝子の略だ。メチレンテトラヒドロ葉酸還元酵素は、この遺伝子が制御している酵素である。体内で5,10-メチレンテトラヒドロ葉酸を5-メチルテトラヒドロ葉酸に変化させるのである。
つまり、葉酸の代謝をコントロールする働きがあるわけである。しかし、これは葉酸代謝の生化学的経路の一つであり、少なくとも15個の主要な経路があることを知っておく必要がある。MTHFRの重要性を軽視するべきではないが、15あるうちの1つであり、すべてが重要だ。
もう一つの遺伝子は、MTHFD遺伝子である。これはメチレンテトラヒドロ葉酸デヒドロゲナーゼの略である。この酵素は、葉酸の代謝における相互に関連するもう一つの4つのステップを制御している。DHFRとFTCDもこの経路に影響を及す。このように、葉酸は重要だが、代謝がうまくいくためには、いくつかの酵素が一体となって働く必要があるのである。
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とはいえ、MTHFRに話を戻しよう。5-メチルテトラヒドロ葉酸を生成させると、その化合物によってホモシステインがメチオニンに戻され、サイクルが再開される。5-メチルテトラヒドロ葉酸は、次にテトラヒドロ葉酸に変化する。これは、ビタミンB12（B12のメチル型、メチルコバラミン）の存在下で、MTR（メチオニン合成酵素）という別の酵素によって行われる。テトラヒドロ葉酸はその後、MTHFD酵素によってさらに数段階の変化を経て、5,10-メチレンテトラヒドロ葉酸に戻り、このサイクルが続く（葉酸の図を参照）。
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MTHFR遺伝子によるこの循環によって、メチオニンは再利用され、ホモシステインは私たちの体内で調節されるのである。これがMTHFR遺伝子の働きである。覚えておいてほしいのは、オンでもオフでもなく、アップかダウンかということだ。であるから、この反応の小さな変化が、これほど大きな議論を引き起こすのは、非常に小さなことのように思える。
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ここから、MTHFRの変異がもたらす影響について理解することができる。MTHFRの主な目的は、メチオニンの循環だ。遺伝や他の反応も関係してくるので、説明するのは難しいのだが。そこで、メチオニンとその循環について説明しよう。
メチオニンは、SAMeという活性体で、さまざまな生化学反応に関与している。それが、メチル化のためのパンチを作るのである。SAMeは主要なメチル供与体なので、多くの生化学反応に必要とされる。
いわば、サイクルが回って、詰まらないようにする必要があるのである。この経路には、他にも重要な遺伝子がある。これらの遺伝子は、ハイパーメチル化因子とハイポメチル化因子と呼ばれるものに影響を与える。
ホモシステインをリサイクルできない場合、体はホモシステインをシスタチオニンに変化させ、代謝して体外に出そうとする。これは、シスタチオニンβ合成酵素を制御するCBSという遺伝子によって行われる。シスタチオニンはその後、遺伝子CTH制御の酵素シスタチオニンγ-リアーゼを介してシステインに変換される。
この過程はトランス硫化と呼ぶことができる。このように、硫黄代謝とメチル化化学は密接に関係している。この経路は、体内の主要なデトックス化学物質の1つであるグルタチオン生成の入り口でもある。これらはすべて硫黄含有アミノ酸（メチオニン、システイン、スレオニン、タウリン）である。
これらの他の遺伝子変異がある場合、システムの活動が悪くなるほど遅くなったり、過剰に活動するほど速くなったりすることがある。システインのように、経路の1つのアミノ酸を作り続けてそれが過剰になると、体に劇的な影響を与える可能性がある。食事性アミノ酸経路は、アミノ酸を化学的に加え、体の代謝に必要なレベルを保つために重要だ。しかし、詰まっては毒になる。
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1920年代後半から30年ほど、アミノ酸のアンバランスがどのような影響を及ぼすのか、また及ぼしうるのかを明らかにするために、動物を使った農業研究が行われた。ウィリアム・サーモン（William Salmon）1が1958年のSymposium on Problems of Human Nutritionで “The Significance of Amino Acid Imbalance in Nutrition” と題する論文を発表している。
この論文で彼は、アミノ酸に対する否定的な反応は、毒性よりも不均衡からくる可能性が高いことを論じようとした。アンバランスとは何か、どのように議論すべきかを正確に言語化するために、含硫アミノ酸でメチオニンの代謝物であるシステインのアミノ酸バランスが数%変化するだけで、肝毒性や出血性壊死を引き起こすことを示した多くの研究を引用している。
その他、トリプトファン、メチオニン、ロイシンなど、個々のアミノ酸のアミノ酸バランスを変えても、同じような、しかし微妙に異なる作用があった。
しかし、食事のアミノ酸バランスを変えることで、さまざまな臓器に不調をきたし、食事が主原因の病気らしい状態を作り出すことが実証された。さらに、遺伝子や酵素による代謝の制御が解明されれば、説得力のある議論になる。
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1982年、栗山、ハクスタブル、岩田が、第5回日本硫黄アミノ酸研究会のために「硫黄アミノ酸：生化学的および臨床的側面」を編集したとき、このことはさらに明白になった。その論文の中に、高メチオニン食をラットに与えたときのことが書かれていた。
この飼料は、ラットの肝臓と脾臓の溶血活性を高め、組織内のメチオニンの量を過剰に増加させることがわかった。その結果、ビリルビンが増加したのである。ビリルビンは、代謝の観点から見ると、赤血球のヘモグロビンが破壊されたものである。
赤血球が死ぬと、体は細胞を切り開き、ヘモグロビンを外に漏らす。そして、ビリベルジンに変換され、最終的にビリルビンとなる。これは肝臓や脾臓で発生するため、肝機能パネルの一部として検査される。しかし、栗山グループの報告にあるように、メチオニンからのメチル化の上昇や不適切なメチル化によって引き起こされることもある。
私自身、このグループの患者さんのアミノ酸検査を行ったことがあるが、ビリルビン値が上昇している方が大半で、ほとんどが正常値、あるいはギルバート症候群のように範囲外の値になっている。
これは、その人の体内でハイパーメチル化と呼ばれるものが発生していることを示す手がかりとなる。であるから、正常な血液化学報告書では、総ビリルビン値が範囲の上3分の1かそれ以上であれば、おそらく高メチル化だ。下限はおそらく低メチル化だ。
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MTHFR酵素の下流効果について見てみると、その重要性は他の遺伝子によって調節されていることがわかる。その連鎖を乱すことで、システムに影響を与えることができるのである。グルタチオンの生産量が少なければ、体内の免疫系やデトックスに問題が生じる。
システインの生産量が少なければ、髪の主成分であるため、髪が問題になる。タウリンの生産量が低下すると、胆汁酸や塩の生産量が減り、脂肪の消化に問題が生じる。これらの経路の相互関係は、最小限に抑えることはできない。
メチオニンをSAMeの形で摂取することで、体の機能を大きく変化させることができる。そのイメージをつかむために、いくつか見てみよう。SAMeが過剰に生成されている場合、過剰に生成されると、より多くのメチル化反応が起こる。
SAMeをメチル基の供与体として使用する酵素を見れば、SAMeがどのように症状を引き起こすか理解できるだろう。SAMeはCOMT（カテコール-O-メチルトランスフェラーゼ）と呼ばれる酵素によって利用される。
この酵素は、様々な形でホルモンを分解し、血流中のエストロゲンとテストステロンの量を調節する。活性が高すぎると、分解が早すぎるため、ホルモンが残らない。
活性が低すぎると、ホルモンが体内に長く留まり、エストロゲン優位性などの原因となる。この酵素は、ドーパミン、ノルエピネフリン、エピネフリン、セロトニン、ヒスタミンといった神経伝達物質の分解も制御している。
また、抹消神経症状Tという酵素は、SAMeのメチル化によってノルエピネフリンをエピネフリンに変化させることも制御している。このように、酵素が体の中でどのような症状を引き起こすか、ほんの数例でお分かりいただけると思う。酵素の量が多すぎても少なすぎても、バランスが悪くても、MTHFRから始まるこの経路の影響を受けるのである。
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本書の趣旨からすると非常に水掛け論になってしまうが、上記の文章から考えられる臨床的な相関性を見てみよう。メチオニンが活性化するためには、体内でATP（アデノシン三リン酸）という分子をつける必要がある（MAT1A遺伝子）。
これは、私たちがエネルギーとして使う分子だ。私たちが脂肪、タンパク質、炭水化物を食べると、それらは最終的なエネルギー源としてATPに変換される。メチオニンにATPが加わると、S-アデノシルメチオニン、別名SAMeと呼ばれる化合物が作られる。
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メチオニンを活性化する際には、エネルギー分子が使われるため、体への影響もある。メチオニンが活性化されると、エネルギーが消費される。この種のメチル化の問題を持つ人々は、常に疲れているというだけでなく、精神状態も不安定になると報告している。
メチオニンをリサイクルするためにATPが何度も何度も使われるため、体の機能を維持するためのエネルギーが枯渇してしまうのである。であるから、メチオニン過剰症の人は、疲れているのに、いつもビクビクしている感じなのである。
一日のうちで周期的に起こり、午後の遅い時間に悪化する。これは、「よく眠れなかった」というような疲労感とは異なる傾向がある。メチオニンがどの程度循環しているかによって、疲れの度合いも変わってくるが、どちらかというと、誰かにプラグを抜かれたような、気を失う前に目を閉じなければならないような感覚だ。
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ここで、「有線」の部分について、他の反応も見ておく必要がある。私たちの体内では、エピネフリン（アドレナリン）と呼ばれる化合物が生成される。エピネフリンは体内のさまざまな場所で作られるが、主に腸と副腎で作られる。
ここで、副腎のどの部分について話しているのか、明らかにしておきよう。人間の副腎には、大脳皮質と髄質の2つの部分がある。皮質部分は、コルチゾールやアルドステロンなどのステロイドや、テストステロンなどの性ホルモンを生成する部分だ。
髄質側は、ノルアドレナリンやアドレナリンとも呼ばれるノルエピネフリンやエピネフリンを生成している。副腎疲労という言葉の医学的な使用から、多くの混乱が生じている。医学的には、アジソン病やクッシング症候群などの副腎の病気と関係がある。
これらは、コルチゾールなどのホルモンに関するもので、ノルエピネフリンやエピネフリンの髄質側、つまりメチル化する側のものではない。ノルエピネフリンとエピネフリンは、交感神経と副交感神経に関係する神経伝達物質ホルモン化合物だ。また、体内の他の多くの化学反応も調節している。
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ノルアドレナリンとアドレナリンは、闘争または逃走のための化学物質で、心臓など一部の臓器では、この2つを同じように使用することができる。メチオニンは、活性型SAMeの形で、PUMTと呼ばれる酵素を介してノルエピネフリンをエピネフリンにメチル化するために使用される。
エピネフリンは、体内に活性型メチオニンがたくさんあるときにたくさん生成される。体内で大量のエピネフリンが浮遊していると困るので、SAMeはCOMTという別の酵素を介してエピネフリンも分解する。COMTはまた、ノルエピネフリン、ドーパミン、ヒスタミン、セロトニンを分解する。
メチオニンによる過剰メチル化は、食事療法の臨床的見地から、これらの神経伝達物質に急激な変化を生じさせる。エピネフリンの発射をオン・オフで繰り返すと、人はたいてい怒りっぽくなったり短気になったりするが、エピネフリンも分解しているので、不安や鬱も出てくる。..疲れや倦怠感も出てくるのである。
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交感神経と副交感神経は、痛みの調節などもコントロールしている。怒りにまかせて壁に穴を開け、手の骨を折る人を思い浮かべてほしい。怒りが収まるまで痛みは感じないかもしれないが、その後、痛みを感じるようになる。このような人がメチル化過剰症になると、しびれや感覚の喪失に加え、一日中痛みが続いたり、痛みが消えたりすることがある。
歯科医は、ノボカインの注射にはエピネフリンが含まれており、ノボカインだけよりも痛みを抑える効果があると言うだろう。交感神経系は、首や肩の筋肉群もコントロールしている。この欠陥がある人は、慢性的な首と背中の上部の痙攣がある。マッサージや鍼治療、カイロプラクティックの調整で改善されるが、同じように再発を繰り返する。過剰メチル化の跳ね返りがある限り、時計仕掛けのように症状が戻ってくるのである。
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筋肉系の話をするついでに、ほとんどのハイパーメチル化症の人が頭痛になることを述べておくる。ほとんどの場合、筋繊維のある後頭部から前頭部にかけての頭痛だ。多くの化学反応からくるものであるが、筋肉の緊張による頭痛は、ハイパーメチル化症の人と関係がある。
心拍数も同じようなシステムでコントロールされている。繰り返するが、これは本書の目的のための単純化されたバージョンである。ハイパーメチル化が起こると心拍数は速くなり、ヒポメチル化が起こると遅くなる。
このため、心拍が速くなる頻脈や心拍が遅くなる徐脈が発生する。また、血圧が高くなったり低くなったりすることもあるようだ。血圧の問題は、バウンシングタイプであることがある。つまり、あるときは低く、あるときは非常に高くなるのである。
ハイパーメチル化モードでは、血管収縮による手足の冷えと、ハイポメチル化によるほてりが出る。ほてりは更年期のほてりとは違い、普段は汗をかかないので、ただ体が上下に熱くなる感じである。これは、次の効果によるものと思われる。
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重度のアレルギーを持つ人は、アナフィラキシーを防ぐためにエピペン®を携帯していると言う。さて、エピペン®にはエピネフリンが入っている。アナフィラキシーは、ヒスタミンが体内に大量に放出されることによって起こる。これにより、血管拡張と循環虚脱が起こる。
エピネフリンの添加により、その効果は無効化される。あなたの体は、これを一日中、普通にやっているのである。エピネフリンが上がればヒスタミンも上がり、ヒスタミンが下がればエピネフリンも下がり、その逆もしかり。この点では、エピネフリンとヒスタミンは姉妹関係にある。
ここでも、これは非常に水掛け論になってしまいますが。突然メチル化過剰になると、エピネフリンの上昇とバランスを取ろうと、ヒスタミンがシステム内で上昇する。
ヒスタミンは、副鼻腔反応から皮膚の発疹、胃酸の問題まで、アレルギーに似た症状を活性化させる。多くの場合、食物アレルギーがこの反応と間違われる。ヒスタミンを多く含む食品やメチル化過剰の食品を食べると、食物アレルギーと同じような反応を示すことがある。もう一度言うが、この例では非常に単純化している。唐辛子を食べると突然鼻水が出たり、胃酸過多の発作が起きたりする人に聞いてみてほしい。これがヒスタミンとメチル化の関係だ。
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いわば腸の中にいるわけであるが、このような高メチル化体質の人に起こるもうひとつの反応は、腸の問題だ。下痢や悪臭を伴うガスが普通であるように見える。これを臨床的に説明しよう。メチオニンを除去する正常な経路が遮断されると、一連の副反応が起こる。
そのうちの1つは、副産物として硫黄の増加を引き起こす。この硫黄は通常、別の硫黄アミノ酸であるシステインに取り込まれるはずである。ところが、この人たちはメチオニンをシステインに正しく代謝しないのである。そのため、ハイパーメチル化症になってしまうのである。
硫黄ミネラルは水素と結合してH2Sガスとして腸に捨てられ、卵の腐ったような臭いがする。また、H2Sガスは水と結合して硫酸を発生させる。この硫酸ガスは消化管全体を刺激し、鼻水、灼熱感、薄い褐色または黄色の下痢を引き起こする。
この黄色は、腸内に硫黄が蓄積されるだけでなく、胆汁酸や塩の生産が低下して便が褐色に変色するためである。メチオニンが正しく代謝されると、そこから硫黄アミノ酸のシステインとタウリンの両方が作られる。
システインはミネラルの硫黄を除去し、タウリンはコレステロールと結合して胆汁酸と塩をつくる。これらは腸のpHを調整したり、色をつけたり、脂肪の消化を助ける働きがある。
便の色で、これらの経路がどのように機能しているかを知ることができるのである。タウリンは胆汁酸や胆汁酸塩の産生を助けるだけでなく、体内で他の多くの働きもすることを忘れてはいけない。タウリンは末梢神経系の制御に役立っている。システインはインスリンの構造にも関与しており、インスリンを体内で働かせるジスルフィド橋の一部を担っている。
つまり、アミノ酸は1つだけでなく、いろいろなことをするのだということを改めて印象づける必要がある。各アミノ酸は、ビルディングブロックとしてすべてのタンパク質の構造に含まれることができ、また含まれているという全体的な理解も加えてほしい。であるから、単一の原因と結果を与えることは難しいのである。だからこそ、生化学的栄養学は病気を治すのではなく、もっと重要なのは体のシステムのバランスを整えることなのである。
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メチル化化学に問題があるため、ハイパーメチル化症の人は、硫黄やメチル化タイプの薬にも問題がある。これらの化合物を正常に除去する経路がないため、重度のアレルギー反応が起こる可能性があるのである。多くの抗生物質は、メチル化酵素を破壊するために、バクテリアのメチル化酵素をターゲットにしている。
メチル化化学に問題がある場合、これらの抗生物質は、すでに低下している肝臓の機能に壊滅的な影響を与えることになる。硫黄を主成分とする薬も同様だ。ミネラルである硫黄は、その除去を助けるためにシステインを必要とするので、システインが適切に作られないと、硫黄系の化合物にも反応するようになる。例えば、尿路感染症によく使われる硫黄系の抗生物質に反応する人は、その例だ。
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肝臓には何種類かの解毒経路がある。つまり、薬や化学物質などの化合物にさらされると、肝臓はそれを解毒し、体外に排出する。このプロセスには、多くの酵素と化学物質が関わっている。ここで説明するには多すぎるが、栄養学的な観点から、いくつかの酵素と化学物質について少し説明しよう。
一般に、この2つの経路はフェーズIとフェーズIIと呼ばれている。栄養学的には、第I相はグルタチオンをはじめとする多くの化合物を利用して、有害物質の除去を促す。フェーズIIと呼ばれる2番目の経路では、メチオニン、システイン、タウリンなどのアミノ酸が使用される。
つまり、体がどのように解毒を助けるかは、メチル化の出来具合と関係があるのである。メチル化に欠陥がある人は、薬物／化学物質による毒性やアレルギータイプの反応を起こしやすくなる可能性がある。メチル化に問題がある人は、こうしたタイプの薬物や化学物質に反応することがあるが、メチル化に関連する栄養素を枯渇させる他の薬物にも反応することがある。メチルに問題がある人は、多くの薬や体の解毒反応にストレスを与えるようなものをうまく使うことができない。
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今、グルタチオン（GSH）がよく話題になっている。化学療法や外部からの化学物質への暴露で発生する毒性ラジカルを体内で除去するのに役立つ。肺の症状やその他の症状にも使用されている。しかし、メチル化の問題を抱える人々にとって、GSHは硫黄含有ペプチドである。
システイン、グルタミン酸、グリシンが含まれている。システインが増えるので、硫黄の経路を介したメチル化異常の問題をより多く引き起こす可能性があるのである。その結果、負のフィードバック阻害と呼ばれる反応によって、メチル化過剰症が引き起こされる可能性がある。
つまり、最終生成物が多すぎると、その最終生成物を作るのをやめてしまうということだ。この化合物を過剰に摂取する前に、自分のシステムがどの程度損なわれているかを知る必要がある（もしそうなら）。ハイパーメチル化やハイポメチル化は、単にオンかオフかではなく、人によってオンとオフの割合が異なるのである。80%機能している人もいれば、25%しか機能していない人もいる。その幅によって、体がどう反応するか、何に影響を受けやすいかが変わってくるのである。
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NAC（N-アセチルシステイン）は、過剰な粘液などに使用される別の栄養化合物だが、やはりこれを摂取する前に、硫黄と含硫アミノ酸を処理する体の能力を調べる必要がある。CBSとCTHの遺伝子がクリアーでなければ、これらは体に負担をかけるだけである。NACなどの栄養素は非常に有効だが、他の食品と同様、摂取する前に体全体を観察し、特定の化学的性質にどのように適合させるかを検討する必要がある。
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このような栄養ベースの化合物は、薬と同じように見ることはできない。薬は、たった1つの経路に作用するように特別に設計されている。栄養素は数十から数百の経路に影響を与えるので、体に組み込まれた安全装置によってより安全だが、単一の症状のために制御することは困難だ。栄養素は、特定の効果を持つ薬剤のような化合物よりも、システム全体のバランスを取る行為として見る方が良いのである。