Covid-19: Is Manaus the final nail in the coffin for natural herd immunity?
www.bmj.com/content/372/bmj.n394
多くの人は、ブラジルのアマゾンでは第一次災害の深刻さから、第二次災害は不可能であると考えてた。第二の危機はマナウス市を唖然とさせ、ルーク・テイラーが報告し、新しい変異体と自然な集団免疫の可能性について疑問を投げかけている。
ブラジル・アマゾンの病院が1月中旬に2度目の崩壊を起こした。
COVID-19を持つ患者の急増は、民間のサプライヤーへのレースに患者の友人や家族を強制的に、地域の首都マナウスの酸素の病院の供給を枯渇させた。暑さと豪雨の中で何時間もキューイングして、彼らは命の恩人であることが判明する可能性がある$70 (£51; €58)シリンダーを購入するのに必死である. 一部の患者は、ベッドが利用可能な他の州に空輸されている。しかし、やはり、収容人数は限られており、危機は病院の壁を越えて広がっているマナウスでは、多くの患者が窒息死している。
「多くの人が病院の入り口や外の救急車の中で死亡しているが、ほとんどの人が死亡し、家族が酸素を求めて街中を捜索している間に自宅で死亡している」と、ブラジルのオズワルド・クルス財団の公衆衛生研究者であるジェセム・オレリャーナ氏は言う。
2020年5月には、毎日約80人の確認されたCOVID-19人の死亡が報告されたが、マナウスはブラジルで最初に大量の墓を掘った都市であった。2021年1月の第2波では、その数は100を超えた。第一波で大きな被害を受けた都市の新たな絶望の高さは、住民や公衆衛生の専門家にも同様に衝撃を与えた。
それは世界中の研究者にも警鐘を鳴らした。多くの人は、前回の発生の規模から、第二の波は不可能だと考えてた。「学界は、集団免疫に近いと考えていた」と、ボゴタのラ・ジャベリアーナ大学の疫学者であるディエゴ・ロッセリは言う。「またしても我々は間違っていた」
さらに、マナウスで新しいウイルスの亜種、P.1が検出された。最近検出された他の亜種と同様に 感染力が強いようである 以前はSARS-CoV-2に対する保護を提供していたが 抗体を逃れる可能性がある
200万人の人口を擁し、周辺に住む無数の先住民のコミュニティの拠点となっている川辺の都市は、ブラジルのパンデミックの震源地であり、すでに世界で2番目に死亡者数が多い国である。
非集団免疫
2020年9月にプレプリントで発表された非査読研究の最初のタイトル「COVID-19 herd immunity in the Brazilian Amazon」は、後から見れば時期尚早であった1。
一つには、サンプルとして献血者を使用したことが結果を歪めた可能性がある。”サンパウロ大学の疫学者であるパウロ・ロトゥフォ氏は、「献血者は人口の特別なサブセットだ」と言う。彼らは家の外で時間を過ごす可能性が高く、COVID-19に感染するリスクが高い仕事に就く可能性が高いと彼は言う。ロトゥフォ氏は、抗体を持っている住民の割合が低い可能性が高いと考えており、最初の研究によって作られた誤った信頼が、2回目の急増を引き起こす役割を果たしたと考えている。
しかし、何人かの主要な疫学者は、この研究の限界を認めつつも、重大な不正確さはあり得ないと考えている。
「モデリングが間違っている可能性があり、人々 の血清有病率（病原体への暴露のマーカーとして、感染している人口の割合を推定するために使用される血液中の血清中で測定された抗体の量）は実際には低い」ハーバード大学の疫学者ウィリアム Hanage は言う。「しかし、それほど低いということはあり得ないと思う」
マナウスでの COVID-19 の予想される致死率を研究の推定 76% の血清有病率を適用すると、そこで報告されているのと同じくらいの量の死亡をもたらすだろう、Hanage と他の人が指摘している。「それは人口の大部分が感染している可能性がある」、ディープティ・グルダサニ、ロンドンのクイーン メアリー大学の疫学者を結論づける。
ドナーは、年齢と所得の一般的な人口をよく反映して、ヌーノ ファリア、研究を共同で主導したオックスフォードの疫学者を論じている。「COVID-19の症状を持つ人々からのサンプルを除外すると、実際には抗体の数が不足している可能性がある 」と彼は言う。
もし人口の大部分がすでに感染していて、抗体のレベルが本当にそれだけ普及していたとしたら、どのようにして感染のレベルが急上昇したのであろうか？
新しい株、新たな恐怖
ウイルスは、人口のほとんどが感染しているにもかかわらず、急速に広がっている可能性がある方法については、3 つの説明がある、と専門家は言う。
一つは、感染後に抗体が徐々に減少していくため、人々がコロナウイルスに再感染しているということだ。この傾向は、昨年7000人の専門家と医療従事者によって署名されたジョン・スノー・メモランダムの中心にある。
しかし、今回のケースでは、その理論は「可能性が低い」ようだとHanage氏は言う。「他の場所での研究では、免疫が少なくとも8ヶ月は持続する傾向があることが示唆されている。マナウスでの症例は5月にピークを迎えた。」
より説得力があり、より懸念されるのは、この状況は変異体であるP.1によって説明できるということだ。
南アフリカで検出されたB.1.351やイギリスで最初に発見されたB.1.1.7のように、P.1は予想よりも早く進化している。そして、B.1.351と同様に、その変異のほとんどは、ヒトの細胞に結合し、浸透するスパイクタンパク質の部位にある。
「これらの突然変異のいくつかは免疫に影響を与えることが知られているが、それらの組み合わせで何をしているのかは分かっていない」とHanage氏は言う。「そして、このような疑わしい何かが流通している場所で、大量の入院や死亡が発生している。それが、私たちがこのような汗だくの手のひらでマナウスを見ている理由の大きな部分だ。」
P.1は、N501Yと呼ばれる突然変異があり、これはB.1.1.7にも存在し、マウスモデルでの感染性の増加と関連している2。
しかし、以前の株からの抗体を回避するために進化した可能性もある。3 抗体が新しい変異体とどのように戦うかを調べる初期の研究では、P.1と南アフリカの変異体の両方に存在するE484Kとして知られる突然変異が、ウイルスが抗体を回避して人々に再感染するのを助けている可能性が示唆されている4。
P.1がマナウスでの症例急増の原因は不明だが、Hanage氏はそれが一役買っているのではないかと考えている。最近の再感染例と同様に、分析によると、マナウスではP.1が支配的な株となっており、現在の危機を引き起こしている可能性が高くなっている。
学ぶべき教訓
P.1の役割を理解するためには、さらなる研究が必要である。しかし、すでに学ぶべき教訓がある。
マナウスの移動手段のデータによると、症例の第一波の後、社交、買い物、仕事のために外出する人々が徐々に増加していることが示されている。活動のピークは、病院が閉鎖される直前のクリスマスであった。社会的距離を保っていないように見える地域社会の不注意な行動と、州知事の不十分な対応が非難されている。
両方とも、その予備研究によって支えられたCOVID-19に対する免疫が地域にできていたという誤った自信に起因している。「パンデミックが終わったという感覚があった。あなたは悪い時を過ごしていたが、今は何をしてもいいという自由があった」とロトゥフォは言う。
州当局は、感染者が増加していた12月26日に15日間の閉店を命じたが、地元の企業や労働者からの街頭抗議を受けて、決定を覆した。
5 マナウスは、一部の人が提案しているように、ウイルスを野放しにしておくことの不確実性と危険性の両方を示している。
「マナウスは、自然感染による集団免疫の追求が保証されていないことを示している。第二に、たとえそれに到達できたとしても、何十万人もの人々がその追求のために死ぬことになる」とグルダサニ氏は言う。「ウイルスが広がれば広がるほど、突然変異の可能性も高くなる」とグルダサニ氏は言う。
地上に戻っても、状況は悲惨なものである。パンデミックの危機に直面しているベネズエラは、不足を緩和するために酸素の供給を提供し、ブラジル空軍は川沿いの都市に物資を空輸しているが、そのギャップを埋めるには十分ではなかった。
ブラジルでは必要な酸素の3分の1しか生産できていないと、国境なき医師団7 は、首都の上流、アマゾンの農村部にある町への影響を警告している。医療インフラの不足と免疫学的にナイーブな人口のため、見当違いの楽観主義と新型インフルエンザの蔓延がさらに壊滅的な影響を及ぼす可能性がある。